RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529728.5

SERGEF-212, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 1,396 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-212ENST00000529728 RMDN3Q96TC7 470 aa29.09■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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SERGEF-212ENST00000529728 EVI5O60447 810 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 PDE4DQ08499 809 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 APOBRQ0VD83 1088 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 PPP2R5BQ15173 497 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 PXMP2Q9NR77 195 aa29.08■■■□□ 2.25
SERGEF-212ENST00000529728 H0YGN5 161 aa29.07■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.07■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.07■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 GOLGA8BA8MQT2 603 aa29.06■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 FGD1P98174 961 aa29.06■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.04■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.04■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 SPC25Q9HBM1 224 aa29.04■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 MYH7BA7E2Y1 1941 aa29.04■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 SCFD2Q8WU76 684 aa29.03■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.02■■■□□ 2.24
SERGEF-212ENST00000529728 MEIS2O14770 477 aa29.02■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.01■■■□□ 2.24
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SERGEF-212ENST00000529728 LTBP2Q14767 1821 aa29.01■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29■■■□□ 2.23
SERGEF-212ENST00000529728 ARIH2O95376 493 aa29■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 RTP1P59025 263 aa29■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.98■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.97■■■□□ 2.23
SERGEF-212ENST00000529728 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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SERGEF-212ENST00000529728 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.97■■■□□ 2.23
SERGEF-212ENST00000529728 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
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