RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 TIFAQ96CG3 184 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 COL20A1Q9P218 1284 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ARIH2O95376 493 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 NEFLP07196 543 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TTC22Q5TAA0 569 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 HERVK_113Q902F9 699 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PBX4Q9BYU1 374 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 KRT23Q9C075 422 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 VWCEQ96DN2 955 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TAAR1Q96RJ0 339 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF576Q9H609 170 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 A6NJR5 290 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 FGBP02675 491 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP2C9P11712 490 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 SEC23AQ15436 765 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 OTOP2Q7RTS6 562 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 FBXO11Q86XK2 927 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 SCLYQ96I15 445 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MAF1Q9H063 256 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TET1Q8NFU7 2136 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 RAD50Q92878 1312 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 B4DLN1 442 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TTLL4Q14679 1199 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 VCANP13611 3396 aa18.27■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PTPRSQ13332 1948 aa18.27■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 OPLAHO14841 1288 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PTH1RQ03431 593 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 CHMLP26374 656 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 LY6KQ17RY6 165 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 SEPT14Q6ZU15 432 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MCF2L2Q86YR7 1114 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 RMDN3Q96TC7 470 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 KLRF2D3W0D1 207 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 KPNA6O60684 536 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 CFBP00751 764 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP21A2P08686 494 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGAP1Q07960 439 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 STXBP2Q15833 593 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 USP38Q8NB14 1042 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 AFG1LQ8WV93 481 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MTMR8Q96EF0 704 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 IWS1Q96ST2 819 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 AMNQ9BXJ7 453 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 CHD7Q9P2D1 2997 aa18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 GH1P01241 217 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MMP3P08254 477 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 HSD17B4P51659 736 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 RAB30Q15771 203 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 SENP2Q9HC62 589 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PXMP2Q9NR77 195 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 MSRAQ9UJ68 235 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 RABGGTBP53611 331 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 GHRHRQ02643 423 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1-206ENST00000526095 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms