RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 GOPCQ9HD26 462 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 RGL1Q9NZL6 768 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 HACL1Q9UJ83 578 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 NFKBIEO00221 500 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 GSDMDP57764 484 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TNIP1Q15025 636 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 RMND1Q9NWS8 449 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 SNHG28P0DPA3 235 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 AMPD3Q01432 767 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MTF1Q14872 753 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 SYT10Q6XYQ8 523 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MTFR1LQ9H019 292 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 KCNJ18B7U540 433 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 KCNJ12Q14500 433 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ECM1Q16610 540 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CEP135Q66GS9 1140 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 FBXO41Q8TF61 875 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 DCAF4Q8WV16 495 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 DDX12PQ92771 950 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 PSMD1Q99460 953 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 INTS13Q9NVM9 706 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF831Q5JPB2 1677 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MYMKA6NI61 221 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 H7C1D1 291 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 PEX10O60683 326 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CASP14P31944 242 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TRIML1Q8N9V2 468 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 BPIFA3Q9BQP9 254 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TRIM9Q9C026 710 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB39O15060 712 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CAP2P40123 477 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CCZ1BP86790 482 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 RBL2Q08999 1139 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MTMR2Q13614 643 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 DAGLBQ8NCG7 672 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 WRNIP1Q96S55 665 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 DNAI1Q9UI46 699 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MEIS2O14770 477 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 TPM1P09493 284 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 GRB10Q13322 594 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 KRT31Q15323 416 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 HAS1Q92839 578 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRK-216ENST00000524481 FAM86B1E9PN63 330 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PSMC6P62333 389 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 VSTM4Q8IW00 320 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 B4DLN1 442 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 IGSF3O75054 1194 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ASNSP08243 561 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GPBP1Q86WP2 473 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 HOOK2Q96ED9 719 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CENPFP49454 3210 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 EPS15P42566 896 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 WDR78Q5VTH9 848 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 LDHDQ86WU2 507 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 GMLQ99445 158 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 CCSER1Q9C0I3 900 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 TRAF5O00463 557 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 LAD1O00515 517 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRK-216ENST00000524481 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms