RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521189.1

CLVS1-207, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,532 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-207ENST00000521189 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KIFAP3Q92845 792 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CLIC6Q96NY7 704 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MTMR9Q96QG7 549 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NUP58Q9BVL2 599 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CD93Q9NPY3 652 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PDP2Q9P2J9 529 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HFM1A2PYH4 1435 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.57□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SULT1B1O43704 296 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CBFA2T3O75081 653 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ANP32DO95626 131 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CCND1P24385 295 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 STK3Q13188 491 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SP140Q13342 867 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CEP78Q5JTW2 689 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 VPS36Q86VN1 386 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 OSBP2Q969R2 916 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HGH1Q9BTY7 390 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 VPS16Q9H269 839 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TRIM17Q9Y577 477 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 BECN2A8MW95 431 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ATP6V1G2O95670 118 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PAHP00439 452 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KRT83P78385 493 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMF1P82094 1093 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MYO1EQ12965 1108 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CRY1Q16526 586 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 UNC5DQ6UXZ4 953 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 AADATQ8N5Z0 425 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 OTUD5Q96G74 571 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NUF2Q9BZD4 464 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 DNAJC18Q9H819 358 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 NOD2Q9HC29 1040 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 EURLQ9NYK6 297 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.56□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CFAP73A6NFT4 308 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MATN2O00339 956 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PSMD14O00487 310 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 N4BP3O15049 544 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RGS20O76081 388 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 OLFM2O95897 454 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GOLGA8HP0CJ92 632 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PDHBP11177 359 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SCG2P13521 617 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GYS1P13807 737 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 IL32P24001 234 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SKOR1P84550 965 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ATL1Q8WXF7 558 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TPK1Q9H3S4 243 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 MAP3K6O95382 1288 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CYP2C9P11712 490 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ALAS1P13196 640 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RXRAP19793 462 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PRKACBP22694 351 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 PAK2Q13177 524 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 KRT71Q3SY84 523 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SDE2Q6IQ49 451 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 CORO6Q6QEF8 472 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 SPATA18Q8TC71 538 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 TRPV6Q9H1D0 765 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 GBA3Q9H227 469 aa7.55□□□□□ -1.2
CLVS1-207ENST00000521189 INIPQ9NRY2 104 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms