RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753		A0A087WZG4	1122 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	GJA9	P57773	515 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	ARID5A	Q03989	594 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	TCEAL1	Q15170	157 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	LNPK	Q9C0E8	428 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	GULP1	Q9UBP9	304 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	PALD1	Q9ULE6	856 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SLC7A5	Q01650	507 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	CABP7	Q86V35	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	DDX11	Q96FC9	970 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	FGD4	Q96M96	766 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	HAUS7	Q99871	368 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	WHRN	Q9P202	907 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HERC4-215	ENST00000515753	AURKA	O14965	403 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NCAPH	Q15003	741 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NTM	Q9P121	344 aa		5.21	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ITGB3	P05106	788 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SEPHS1	P49903	392 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ADAM17	P78536	824 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	PEX11G	Q96HA9	241 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	GBP3	Q9H0R5	595 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	FUCA1	P04066	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NTRK1	P04629	796 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	EPHX1	P07099	455 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NAT2	P11245	290 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	GRB10	Q13322	594 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	STK32C	Q86UX6	486 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NETO2	Q8NC67	525 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	C8B	P07358	591 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	TNFRSF1A	P19438	455 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	SLC9A5	Q14940	896 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ARMC5	Q96C12	935 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	C7orf72	A4D263	438 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	PPM1B	O75688	479 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ZBTB7A	O95365	584 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	CYP2C8	P10632	490 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	PAM	P19021	973 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ETFB	P38117	255 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	ZXDA	P98168	799 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	AMPD2	Q01433	879 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HERC4-215	ENST00000515753	PPP2R5E	Q16537	467 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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