RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 SNAP25P60880 206 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CXCL9Q07325 125 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PDE4DQ08499 809 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KCNJ18B7U540 433 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP6O43182 974 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CCP110O43303 1012 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R2P41236 205 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ECE1P42892 770 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KCNJ12Q14500 433 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.63■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 RAD54LQ92698 747 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 GOPCQ9HD26 462 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ACER1Q8TDN7 264 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.62■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 MARCH6O60337 910 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 STX10O60499 249 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 STAT2P52630 851 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 MCM6Q14566 821 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 USH1GQ495M9 461 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TTI2Q6NXR4 508 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 THAP9Q9H5L6 903 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP4P98171 946 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 HYIQ5T013 277 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 IRF2BP1Q8IU81 584 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.61■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 MYMKA6NI61 221 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 SLC26A4O43511 780 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC125Q86Z20 511 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PANX2Q96RD6 677 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.6■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 N4BP3O15049 544 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB7AO95365 584 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 STK4Q13043 487 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 UNC13DQ70J99 1090 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 OPLAHO14841 1288 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 CCNE1P24864 410 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 SREBF1P36956 1147 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 PPFIBP1Q86W92 1011 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 P2RX5Q93086 422 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM47Q96LD4 638 aa25.59■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 BICDL2A1A5D9 508 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 WNT10BO00744 389 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 MAP3K10Q02779 954 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 TRAF1Q13077 416 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 KCNK18Q7Z418 384 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 GJA10Q969M2 543 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4D-223ENST00000515011 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FCER1AP12319 257 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 CAP2P40123 477 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 VPS16Q9H269 839 aa25.58■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 PIK3CDO00329 1044 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 TUBB4AP04350 444 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 RBL2Q08999 1139 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 ECM1Q16610 540 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 Q4G0T1 1027 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 NT5C3AQ9H0P0 336 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 VCPKMTQ9H867 229 aa25.57■■□□□ 1.68
PDE4D-223ENST00000515011 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.57■■□□□ 1.68
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