RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PXMP2Q9NR77 195 aa20.62■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PGK1P00558 417 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 NEK4P51957 841 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 NAPAP54920 295 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC41Q15345 812 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 MCM3APO60318 1980 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 LCTP09848 1927 aa20.61■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PIK3CDO00329 1044 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 NR3C2P08235 984 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 IFNAR1P17181 557 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 AK2P54819 239 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 STK3Q13188 491 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SCFD2Q8WU76 684 aa20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 DPF3Q92784 378 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PHKBQ93100 1093 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 BARHL2Q9NY43 387 aa20.59■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SCG2P13521 617 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SMPD1P17405 629 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 GJA9P57773 515 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PGM5Q15124 567 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 NTRK3Q16288 839 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 Q9Y3F1 56 aa20.58■□□□□ 0.89
FAAP20-215ENST00000514625 FRMPD3Q5JV73 1810 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 STXBP3O00186 592 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 MEIS2O14770 477 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ADCY6O43306 1168 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTS4O75173 837 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 CDKL5O76039 1030 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 COL6A1P12109 1028 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 CCND2P30279 289 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TTLL4Q14679 1199 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TLK2Q86UE8 772 aa20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 SMCO2A6NFE2 343 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PFKFB2O60825 505 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ADCY7P51828 1080 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 GNASQ5JWF2 1037 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.56■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PHF24Q9UPV7 400 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.55■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 ZEB2O60315 1214 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 EVI5O60447 810 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PPFIA3O75145 1194 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 STAM2O75886 525 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 SCRN1Q12765 414 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 KCNA10Q16322 511 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 PKN1Q16512 942 aa20.54■□□□□ 0.88
FAAP20-215ENST00000514625 UBE2SQ16763 222 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms