RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP2-215ENST00000510074 GPCPD1Q9NPB8 672 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP2-215ENST00000510074 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.71■□□□□ 0.59
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SH3BP2-215ENST00000510074 COPS5Q92905 334 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-215ENST00000510074 DCTPP1Q9H773 170 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-215ENST00000510074 TOMM22Q9NS69 142 aa18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP2-215ENST00000510074 GJD3Q8N144 294 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 C7orf31Q8N865 590 aa18.64■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 ERVK-21P61565 698 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.63■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 SESTD1Q86VW0 696 aa18.63■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 PDHBP11177 359 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 DGKDQ16760 1214 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 USH1GQ495M9 461 aa18.62■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 TET1Q8NFU7 2136 aa18.62■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC01553A4QN01 128 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 FOXP2O15409 715 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 NBNO60934 754 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 CXCL10P02778 98 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 FGRP09769 529 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF543Q08ER8 600 aa18.61■□□□□ 0.57
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SH3BP2-215ENST00000510074 VPS53Q5VIR6 699 aa18.61■□□□□ 0.57
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