RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 NFRKBQ6P4R8 1299 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 IQCA1Q86XH1 822 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 DGKHQ86XP1 1220 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 RGS22Q8NE09 1264 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 NOD1Q9Y239 953 aa19.17■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 A6NJR5 290 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 TNFRSF10AO00220 468 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 SDSP20132 328 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 RFC2P35250 354 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 NT5C2P49902 561 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 CHMP4BP1P59074 171 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 IL27Q8NEV9 243 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 COPS5Q92905 334 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 ASB2Q96Q27 587 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 KAT14Q9H8E8 782 aa19.16■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 MYOGP15173 224 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 BFSP2Q13515 415 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 PNMA1Q8ND90 353 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 MAF1Q9H063 256 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 NEDD4P46934 1319 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 GBF1Q92538 1859 aa19.15■□□□□ 0.66
ITGA3-211ENST00000508100 PITPNM1O00562 1244 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 KDM4AO75164 1064 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 AAMPQ13685 434 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 MCF2L2Q86YR7 1114 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 MICALL1Q8N3F8 863 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 VWCEQ96DN2 955 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CPVLQ9H3G5 476 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ABCB11O95342 1321 aa19.14■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 IQCF3P0C7M6 154 aa19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SLC9A7Q96T83 725 aa19.13■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 KIF28PB7ZC32 967 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ARIH2O95376 493 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 GH1P01241 217 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 STXBP2Q15833 593 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ASPRV1Q53RT3 343 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SMC5Q8IY18 1101 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRF4Q8IZF3 695 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 AFG1LQ8WV93 481 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 IWS1Q96ST2 819 aa19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 B4E1Z4 1266 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 HIP1O00291 1037 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CA3P07451 260 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 PTGISQ16647 500 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC62Q6P9F0 684 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CHD1LQ86WJ1 897 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D5Q92609 795 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ANKS1AQ92625 1134 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 RMDN3Q96TC7 470 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 VAT1LQ9HCJ6 419 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.11■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SCN5AQ14524 2016 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CASTP20810 708 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 LY6KQ17RY6 165 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ARHGEF16Q5VV41 709 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CHST3Q7LGC8 479 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 FBXO11Q86XK2 927 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.1■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 NCOR1O75376 2440 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 MMP3P08254 477 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 QRICH1Q2TAL8 776 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 CAGE1Q8TC20 777 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 UBAC1Q9BSL1 405 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 KRT23Q9C075 422 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 ZSWIM5Q9P217 1185 aa19.09■□□□□ 0.65
ITGA3-211ENST00000508100 BAIAP3O94812 1187 aa19.08■□□□□ 0.64
ITGA3-211ENST00000508100 KCNJ6P48051 423 aa19.08■□□□□ 0.64
ITGA3-211ENST00000508100 NUCB1Q02818 461 aa19.08■□□□□ 0.64
ITGA3-211ENST00000508100 ARHGAP1Q07960 439 aa19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms