RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANTXR2P58335 489 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL4Q14679 1199 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COPS5Q92905 334 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IWS1Q96ST2 819 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIN2DO15399 1336 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD4P01730 458 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TROAPQ12815 778 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STXBP2Q15833 593 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CASC1Q6TDU7 716 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEPT14Q6ZU15 432 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SKAP1Q86WV1 359 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM199Q8N511 208 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIGSQ96S52 555 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR10Q9NXD2 777 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF1Q13077 416 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PURAQ00577 322 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OPLAHO14841 1288 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC27A2O14975 620 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRC1O43663 620 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARIH2O95376 493 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2C18P33260 490 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSD17B4P51659 736 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIPK3Q9H422 1215 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PXMP2Q9NR77 195 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B4GALT4O60513 344 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KPNA6O60684 536 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NR3C2P08235 984 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSF2RAP15509 400 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCM5P33992 734 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF697Q5TEC3 545 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC62Q6P9F0 684 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM161BQ96MY7 647 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY9Q9HBG7 655 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NJR5 290 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYTH3O43739 400 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY6KQ17RY6 165 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GH1P01241 217 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NECTIN1Q15223 517 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM47CQ5HY64 1035 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMTC2Q8N394 836 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTA3Q9BTC8 594 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL10Q9BUA6 226 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC69A6NI79 296 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDAH1O94760 285 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR2MP0CAP2 368 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACRP10323 421 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF5BP33176 963 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GHRHRQ02643 423 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF20Q3BBV1 942 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM87BQ96K49 555 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K14Q99558 947 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP4BP1P59074 171 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM240Q5SV17 173 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf59Q7L2K0 433 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AFG1LQ8WV93 481 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UMODL1Q5DID0 1318 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCL23P55773 120 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCHSD1Q86WN1 690 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL23AQ9NPF7 189 aa27■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
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