RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	UPP2	O95045	317 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE6A	P16499	860 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLIM4	O00461	696 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ACR	P10323	421 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF2RA	P15509	400 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ABL2	P42684	1182 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB30	Q15771	203 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ELP1	O95163	1332 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA5A	O00534	786 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP1	P13497	986 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ASGR1	P07306	291 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK8	P49336	464 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIOB	Q8N635	442 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JMZ2	1700 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MYADML2	A6NDP7	307 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ARVCF	O00192	962 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAB2	O43741	272 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD4	O95243	580 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G5	P39877	138 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB15	P59190	212 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CPXCR1	Q8N123	301 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L12	C9JPN9	530 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	USP17L21	D6R901	530 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED4	O75132	1171 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	FGB	P02675	491 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2C18	P33260	490 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SKAP2-209	ENST00000497511	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33

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