RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 ALG3Q92685 438 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 NBPF4Q96M43 638 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 NCAM1P13591 858 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 PI3P19957 117 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 EPHB3P54753 998 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 PRR5P85299 388 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.3□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 KLF4O43474 513 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CHRNA2Q15822 529 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 MROH9Q5TGP6 573 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 C1QL4Q86Z23 238 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 FRS2Q8WU20 508 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 ARMC5Q96C12 935 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 MTA3Q9BTC8 594 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 BTG4Q9NY30 223 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 LTBRP36941 435 aa7.28□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 GFRA1P56159 465 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 PPP2R2AP63151 447 aa7.28□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 DPH6Q7L8W6 267 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RBM39-241ENST00000496183 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.28□□□□□ -1.24
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RBM39-241ENST00000496183 MAP4K2Q12851 820 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 SSPNQ14714 243 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 SEC14L1Q92503 715 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 TMEM169Q96HH4 297 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 LGR4Q9BXB1 951 aa7.27□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.27□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.26□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PQU0 124 aa7.25□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 CEP68Q76N32 757 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 DDX11Q96FC9 970 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 PWWP2AQ96N64 755 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 IER2Q9BTL4 223 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 H7BY64 318 aa7.24□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 INF2Q27J81 1249 aa7.24□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.24□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.24□□□□□ -1.25
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RBM39-241ENST00000496183 PDPK1O15530 556 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 SASH1O94885 1247 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 APPP05067 770 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 ASGR2P07307 311 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 FGFR1P11362 822 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 MTERF2Q49AM1 385 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-241ENST00000496183 SP8Q8IXZ3 490 aa7.23□□□□□ -1.25
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