RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	KCTD3	Q9Y597	815 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CBWD5-231	ENST00000495615	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	BTG4	Q9NY30	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	NUAK1	O60285	661 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	DLX3	O60479	287 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	NTRK1	P04629	796 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	FPR2	P25090	351 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	TESK1	Q15569	626 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SPATC1	Q76KD6	591 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	MC3R	P41968	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	DIO2	Q92813	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	AGRP	O00253	132 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CP	P00450	1065 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ATF2	P15336	505 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	BCL6	P41182	706 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	LIMS1	P48059	325 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SERINC3	Q13530	473 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CABP7	Q86V35	215 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615		Q8N1Y9	231 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	NETO2	Q8NC67	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	USP33	Q8TEY7	942 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	CCDC140	Q96MF4	163 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	C22orf46	C9J442	243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ASGR2	P07307	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PML	P29590	882 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	LTBR	P36941	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	MAP4K2	Q12851	820 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM129C	Q86XR2	697 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SGSM3	Q96HU1	749 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	BLACE	A4D250	179 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PDPK1	O15530	556 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PRODH	O43272	600 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	ADCY3	O60266	1144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	MSC	O60682	206 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	NTRK3	Q16288	839 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	IQCE	Q6IPM2	695 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CBWD5-231	ENST00000495615	SGSM2	O43147	1006 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	RBL2	Q08999	1139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	SOGA3	Q5TF21	947 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	CEP68	Q76N32	757 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	ALG3	Q92685	438 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	PEX11G	Q96HA9	241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615		X6R8D5	127 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	FGFR1	P11362	822 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	RASA3	Q14644	834 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF385B	Q569K4	471 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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