RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	IQCA1	Q86XH1	822 aa		18.59	■□□□□ 0.57
AKAP9-215	ENST00000493976	DNER	Q8NFT8	737 aa		18.59	■□□□□ 0.57
AKAP9-215	ENST00000493976	HERVK_113	Q902F9	699 aa		18.59	■□□□□ 0.57
AKAP9-215	ENST00000493976	KAT14	Q9H8E8	782 aa		18.59	■□□□□ 0.57
AKAP9-215	ENST00000493976	TET1	Q8NFU7	2136 aa		18.58	■□□□□ 0.57
AKAP9-215	ENST00000493976	HIP1	O00291	1037 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CYP2C9	P11712	490 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CPT1A	P50416	773 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PNMA2	Q9UL42	364 aa		18.58	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	ABCB11	O95342	1321 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SCFD2	Q8WU76	684 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MYO9B	Q13459	2157 aa		18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976		A6NJR5	290 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	OPLAH	O14841	1288 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SEC23A	Q15436	765 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	RGS22	Q8NE09	1264 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		18.56	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FGB	P02675	491 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	NT5C2	P49902	561 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	TTC22	Q5TAA0	569 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		18.55	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	RABGGTB	P53611	331 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	ARHGAP1	Q07960	439 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	LY6K	Q17RY6	165 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	KRT23	Q9C075	422 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	RAD50	Q92878	1312 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PTH1R	Q03431	593 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	ADGRE1	Q14246	886 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	TTLL4	Q14679	1199 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	FBXO11	Q86XK2	927 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SENP2	Q9HC62	589 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		18.53	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MMP3	P08254	477 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	CYP21A2	P08686	494 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	MYOG	P15173	224 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	AFG1L	Q8WV93	481 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	RMDN3	Q96TC7	470 aa		18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
AKAP9-215	ENST00000493976	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	RAB30	Q15771	203 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CHST3	Q7LGC8	479 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	KAT2B	Q92831	832 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MTMR8	Q96EF0	704 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PXMP2	Q9NR77	195 aa		18.51	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	ZBBX	A8MT70	800 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976		B4DLN1	442 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	KLRF2	D3W0D1	207 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CFB	P00751	764 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	HSD17B4	P51659	736 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	CHMP4BP1	P59074	171 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	GHRHR	Q02643	423 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		18.5	■□□□□ 0.55
AKAP9-215	ENST00000493976	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55

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