RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 CHST3Q7LGC8 479 aa21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 SCFD2Q8WU76 684 aa21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 VWCEQ96DN2 955 aa21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.52■■□□□ 1.04
CHD1L-209ENST00000492728 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 KLRF2D3W0D1 207 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 E7EWF7 191 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF365Q70YC5 407 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 SKAP1Q86WV1 359 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM199Q8N511 208 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MYH6P13533 1939 aa21.51■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CPT1AP50416 773 aa21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CCL23P55773 120 aa21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 GRM4Q14833 912 aa21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MYLIPQ8WY64 445 aa21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 A6NJR5 290 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CYTH3O43739 400 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 DNAJB2P25686 324 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PBX2P40425 430 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 HSD17B4P51659 736 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 GHRHRQ02643 423 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 LY6KQ17RY6 165 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 RMDN3Q96TC7 470 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 IL23AQ9NPF7 189 aa21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CYP2C9P11712 490 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 ARHGAP1Q07960 439 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TROAPQ12815 778 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TRDNQ13061 729 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TTLL4Q14679 1199 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MAP4K1Q92918 833 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 SCLYQ96I15 445 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 AMNQ9BXJ7 453 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 VCANP13611 3396 aa21.48■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB5O15062 677 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 CFBP00751 764 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 HOMER1Q86YM7 354 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PIGSQ96S52 555 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MAF1Q9H063 256 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PXMP2Q9NR77 195 aa21.47■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 MMP3P08254 477 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 WTAPQ15007 396 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 NCOA7Q8NI08 942 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 IL31RAQ8NI17 732 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 AFG1LQ8WV93 481 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 HERVK_113Q902F9 699 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PBX4Q9BYU1 374 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.46■■□□□ 1.03
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 RGS20O76081 388 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 NR3C2P08235 984 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 GRIN2CQ14957 1233 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 STXBP2Q15833 593 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 IWS1Q96ST2 819 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.45■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 B4DLN1 442 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 KAT2BQ92831 832 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 TIFAQ96CG3 184 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms