RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 USP7Q93009 1102 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PTPRC-212ENST00000491302 LSAMPQ13449 338 aa10.55□□□□□ -0.72
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PTPRC-212ENST00000491302 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.51□□□□□ -0.73
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PTPRC-212ENST00000491302 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.5□□□□□ -0.73
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PTPRC-212ENST00000491302 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.5□□□□□ -0.73
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PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRC-212ENST00000491302 FADS2P1A8MWK0 482 aa10.47□□□□□ -0.73
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