RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 CYTH3O43739 400 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 B4GALT4O60513 344 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R5BQ15173 497 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 MCF2L2Q86YR7 1114 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 AMNQ9BXJ7 453 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 TRPV6Q9H1D0 765 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 RIOX1Q9H6W3 641 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 UMODL1Q5DID0 1318 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB3-211ENST00000490677 A6NJR5 290 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 CSF2RAP15509 400 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 CYP2C18P33260 490 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 CPT1AP50416 773 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 HSD17B4P51659 736 aa32.38■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 SKAP1Q86WV1 359 aa32.38■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 UNC80Q8N2C7 3258 aa32.38■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 TANC1Q9C0D5 1861 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0C4DFX4 3053 aa32.37■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 TMEM240Q5SV17 173 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 RMDN3Q96TC7 470 aa32.37■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 B4DLN1 442 aa32.36■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM161BQ96MY7 647 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 IWS1Q96ST2 819 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 VWCEQ96DN2 955 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 PXMP2Q9NR77 195 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 CHD9Q3L8U1 2897 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL4Q14679 1199 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF697Q5TEC3 545 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM199Q8N511 208 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 PIGSQ96S52 555 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 HIPK3Q9H422 1215 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB3-211ENST00000490677 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 MYL3P08590 195 aa32.33■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 LY9Q9HBG7 655 aa32.33■■■□□ 2.77
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HOXB3-211ENST00000490677 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 ERICH2A1L162 156 aa32.31■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 LY6KQ17RY6 165 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 SEPT14Q6ZU15 432 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF365Q70YC5 407 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 HOMER1Q86YM7 354 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 IL23AQ9NPF7 189 aa32.31■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 NBPF20Q3BBV1 942 aa32.3■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF16Q5VV41 709 aa32.3■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 KPNA6O60684 536 aa32.29■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 PDCD2LQ9BRP1 358 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 MTA3Q9BTC8 594 aa32.29■■■□□ 2.76
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC27A2O14975 620 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 SAMD3Q8N6K7 520 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 IL31RAQ8NI17 732 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 AFG1LQ8WV93 481 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K14Q99558 947 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 MYO9BQ13459 2157 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB3-211ENST00000490677 MMP3P08254 477 aa32.27■■■□□ 2.76
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