RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TADA3O75528 432 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EGFRP00533 1210 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF569Q5MCW4 686 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNKSR1Q969H4 720 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSDMAQ96QA5 445 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GNA11P29992 359 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXLNAP40222 546 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC10P48553 1259 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO1BO43795 1136 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARCH6O60337 910 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GYPCP04921 128 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAT3P40763 770 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK18Q7Z418 384 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFR2Q9UP52 801 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.36■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F5H6K3 240 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMP15O95972 392 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLRC3Q07444 240 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAK1Q13153 545 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL4A5P29400 1685 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCM6Q14566 821 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CALCRLQ16602 461 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STYK1Q6J9G0 422 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D5Q92609 795 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRG1Q9Y653 693 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOCADQ5VW36 1801 aa17.35■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFAP3LO75121 409 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2C19P33261 490 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LONP1P36776 959 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASIC1P78348 528 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBXN1Q04323 297 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECM1Q16610 540 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT25Q7Z3Z0 450 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LCMT1Q9UIC8 334 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPM1P09493 284 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC41Q15345 812 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASPRV1Q53RT3 343 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTLL6Q8N841 843 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC39A2Q9NP94 309 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNJ18B7U540 433 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NDUFB10O96000 172 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDEP14735 1019 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNJ12Q14500 433 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.34■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK4Q13043 487 aa17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC174Q6PII3 467 aa17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIFC2Q96AC6 838 aa17.33■□□□□ 0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF5CO60282 957 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNHG28P0DPA3 235 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPB1P53618 953 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRWD1Q9UFC0 647 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SWAP70Q9UH65 585 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRFAP1Q9Y605 127 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIPA1L1O43166 1804 aa17.33■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB8A8MWE9 144 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB5O15062 677 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNA3P22001 575 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT9P35527 623 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K9P80192 1104 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.32■□□□□ 0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms