RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	EVC	P57679	992 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	STRN3	Q13033	797 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	RMDN3	Q96TC7	470 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TROAP	Q12815	778 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MTMR2	Q13614	643 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABCB11	O95342	1321 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP7D2	Q96T17	732 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	FCER1A	P12319	257 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBL2	Q08999	1139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DDX12P	Q92771	950 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CETN2	P41208	172 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	KCTD2	Q14681	263 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYOM1	P52179	1685 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	RASSF7	Q02833	373 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GRM4	Q14833	912 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP37	Q86T82	979 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SESTD1	Q86VW0	696 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274		H0YHG0	523 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TEX33	O43247	280 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	DDIT3	P35638	169 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	ORC4	O43929	436 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRPC3	Q13507	836 aa		11.72	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms