RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SDHB	P21912	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FPR2	P25090	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	BCL6	P41182	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GTF2A2	P52657	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GPR85	P60893	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	DPF3	Q92784	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	AQP7	O14520	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ENPP3	O14638	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PLD2	O14939	933 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PDE6B	P35913	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TCEA2	Q15560	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CEP68	Q76N32	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CABP7	Q86V35	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	2e-21	■■□□□ 12.4
TARDBP-208	ENST00000477447	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	C22orf46	C9J442	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	EFCAB14	O75071	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RASGRP1	O95267	797 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GRK2	P25098	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GRK3	P35626	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	LSAMP	Q13449	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FEZ1	Q99689	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447		H7BY64	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CRTAM	O95727	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	NTRK1	P04629	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	DBH	P09172	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447		Q8N1Y9	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	SOD2	P04179	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	APP	P05067	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	MPO	P05164	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	GLI4	P10075	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	NAT1	P18440	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	HSD3B2	P26439	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-208	ENST00000477447	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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