RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 RFXAPO00287 272 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 NFIBO00712 420 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 ORC4O43929 436 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 SNAP25P60880 206 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 SYDE2Q5VT97 1194 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 CERS4Q9HA82 394 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2Q1-202ENST00000467683 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 EPOPA6NHQ4 379 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPR37L1O60883 481 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 EDNRBP24530 442 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CALML3P27482 149 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GRB10Q13322 594 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 MAF1Q9H063 256 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 MTMR7Q9Y216 660 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 NMT2O60551 498 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 EFCAB14O75071 495 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 SESTD1Q86VW0 696 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 LPXNO60711 386 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 FGRP09769 529 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 SELPP16109 830 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC16A2P36021 539 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 WDR5P61964 334 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RBL2Q08999 1139 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PTGISQ16647 500 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 KRT40Q6A162 431 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGEF15O94989 841 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TTBK2Q6IQ55 1244 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGS22Q8NE09 1264 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PI4K2BQ8TCG2 481 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 FOXP2O15409 715 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GJB5O95377 273 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GH1P01241 217 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CXCL10P02778 98 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PDHBP11177 359 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PCP11498 1178 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CASTP20810 708 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ALX1Q15699 326 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TTC14Q96N46 770 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RAD9AQ99638 391 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TOMM22Q9NS69 142 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 MMP3P08254 477 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 MX1P20591 662 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERVK-21P61565 698 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF543Q08ER8 600 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 TICAM2Q86XR7 235 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 COPS5Q92905 334 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 INCENPQ9NQS7 918 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZMYM6O95789 1325 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 LAMA4Q16363 1823 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2Q1-202ENST00000467683 LCHNA4D1U4 455 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRR33A8MZF0 331 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARIH2O95376 493 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 SNHG28P0DPA3 235 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 NT5C2P49902 561 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHMP4BP1P59074 171 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 IKBKEQ14164 716 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 DGKDQ16760 1214 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 LEXMQ3ZCV2 418 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 AFG1LQ8WV93 481 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 IWS1Q96ST2 819 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 CRBNQ96SW2 442 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 C11orf16Q9NQ32 467 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2Q1-202ENST00000467683 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms