RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 MS4A14Q96JA4 679 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ORAI2Q96SN7 254 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 DNM1LO00429 736 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 TRAPPC3O43617 180 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 CALM1P0DP23 149 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 CALM2P0DP24 149 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 CALM3P0DP25 149 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 PPP1R2P41236 205 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ALS2Q96Q42 1657 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 A0A1B0GUA9 196 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 XRCC4Q13426 336 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 GREM2Q9H772 168 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 C5orf60A6NFR6 353 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 MYZAPP0CAP1 466 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 NLRP5P59047 1200 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 MTMR8Q96EF0 704 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.9□□□□□ -0.02
SRPRB-201ENST00000466490 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LPIN2Q92539 896 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TROAPQ12815 778 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 BIRC3Q13489 604 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SCLT1Q96NL6 688 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.89□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SCTRP47872 440 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 KRT12Q99456 494 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MGRN1O60291 552 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 DDAH1O94760 285 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RASSF7Q02833 373 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 BUB1O43683 1085 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PAEPP09466 180 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MYBP10242 640 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 GHRP10912 638 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 SCG2P13521 617 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 FGFR2P21802 821 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 RASGRF1Q13972 1273 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 VWA3BQ502W6 1294 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 ISCUQ9H1K1 167 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.88□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LRRC53A6NM62 1247 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 H0YGN5 161 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 EPHB6O15197 1021 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 UBA7P41226 1012 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CTSWP56202 376 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 PPP2R5AQ15172 486 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 QPCTQ16769 361 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 LRRC45Q96CN5 670 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 CUEDC2Q9H467 287 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 NFS1Q9Y697 457 aa14.87□□□□□ -0.03
SRPRB-201ENST00000466490 MYH3P11055 1940 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms