RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 KLRK1P26718 216 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KRT9P35527 623 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 STX17P56962 302 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 INF2Q27J81 1249 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 P2RX5Q93086 422 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ACBD3Q9H3P7 528 aa9.52□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 C6orf229H3BNL8 230 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KLRC4O43908 158 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SNHG28P0DPA3 235 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZBED6P86452 979 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LRRC63Q05C16 580 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 IQCEQ6IPM2 695 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RUBCNQ92622 972 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TRIM47Q96LD4 638 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MTRQ99707 1265 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TRIM9Q9C026 710 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 VPS16Q9H269 839 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ANO9A1A5B4 782 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CCDC66A2RUB6 948 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 USP17L3A6NCW0 530 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 USP17L4A6NCW7 530 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NFKBIEO00221 500 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PSMD14O00487 310 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PPIP5K2O43314 1243 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CYTH3O43739 400 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 NDUFA10O95299 355 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GNA14O95837 355 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TTLL1O95922 423 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DOAP06340 250 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE8P0CG41 777 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.893e-56■□□□□ 10.1
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ADCY7P51828 1080 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RHBDL3P58872 404 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CHMP4BP1P59074 171 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 PDE4DQ08499 809 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MEA1Q16626 185 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 KRT79Q5XKE5 535 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CENPPQ6IPU0 288 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TTI2Q6NXR4 508 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 UNC13DQ70J99 1090 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 MTMR9Q96QG7 549 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 WDR24Q96S15 920 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TSG101Q99816 390 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 EHD4Q9H223 541 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTB-208ENST00000464611 FLT1P17948 1338 aa9.5□□□□□ -0.89
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