RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CLTBP09497 229 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXB3-202ENST00000460160 CDK7P50613 346 aa27.46■■□□□ 1.99
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HOXB3-202ENST00000460160 SCFD2Q8WU76 684 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXB3-202ENST00000460160 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXB3-202ENST00000460160 NEK1Q96PY6 1258 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXB3-202ENST00000460160 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.46■■□□□ 1.99
HOXB3-202ENST00000460160 TDHQ8IZJ6 230 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 IWS1Q96ST2 819 aa27.45■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 FAAP100Q0VG06 881 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 TRAF1Q13077 416 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 PPP2R5BQ15173 497 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 PXMP2Q9NR77 195 aa27.44■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 ZEB2O60315 1214 aa27.43■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.43■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0355O15063 1070 aa27.42■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 ARIH2O95376 493 aa27.42■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 SMARCA1P28370 1054 aa27.42■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 BADQ92934 168 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 MROH7Q68CQ1 1323 aa27.42■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 OR6J1Q8NGC5 347 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 COPS5Q92905 334 aa27.41■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.39■■□□□ 1.98
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HOXB3-202ENST00000460160 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-202ENST00000460160 ITGA7Q13683 1181 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.38■■□□□ 1.97
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HOXB3-202ENST00000460160 APOA5Q6Q788 366 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 LRCH3Q96II8 777 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.38■■□□□ 1.97
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HOXB3-202ENST00000460160 IL31RAQ8NI17 732 aa27.37■■□□□ 1.97
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HOXB3-202ENST00000460160 LY6KQ17RY6 165 aa27.36■■□□□ 1.97
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HOXB3-202ENST00000460160 RGS20O76081 388 aa27.35■■□□□ 1.97
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HOXB3-202ENST00000460160 MYL3P08590 195 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-202ENST00000460160 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.35■■□□□ 1.97
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