RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453458.5

TNNT3-211, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene TNNT3, Length 699 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-211ENST00000453458 COL20A1Q9P218 1284 aa8.58□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.58□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.58□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MYO9BQ13459 2157 aa8.58□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ABCB11O95342 1321 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 RAD50Q92878 1312 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PTPRSQ13332 1948 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 B4DLN1 442 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 KLRF2D3W0D1 207 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 DNAJB2P25686 324 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CPT1AP50416 773 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PPP2R5BQ15173 497 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 LY6KQ17RY6 165 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CHST3Q7LGC8 479 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SCFD2Q8WU76 684 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MYLIPQ8WY64 445 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SENP2Q9HC62 589 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 IL23AQ9NPF7 189 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 REV3LO60673 3130 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TET1Q8NFU7 2136 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.57□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 A6NJR5 290 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 E7EWF7 191 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 OPLAHO14841 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SGSM2O43147 1006 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CFBP00751 764 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 FGBP02675 491 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CYP2C9P11712 490 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PBX2P40425 430 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TRDNQ13061 729 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TTLL4Q14679 1199 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 GRIN2CQ14957 1233 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 STXBP2Q15833 593 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 RASIP1Q5U651 963 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MTMR8Q96EF0 704 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SCLYQ96I15 445 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 RMDN3Q96TC7 470 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PBX4Q9BYU1 374 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MAF1Q9H063 256 aa8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ZBTB5O15062 677 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CHMP4BP1P59074 171 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 GRM4Q14833 912 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 HOMER1Q86YM7 354 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NCOA7Q8NI08 942 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 AFG1LQ8WV93 481 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 HERVK_113Q902F9 699 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MAP4K1Q92918 833 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 TIFAQ96CG3 184 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 VWCEQ96DN2 955 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PIGSQ96S52 555 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 IWS1Q96ST2 819 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 AMNQ9BXJ7 453 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ZNF576Q9H609 170 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PXMP2Q9NR77 195 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.55□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 KAT6AQ92794 2004 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 ERICH2A1L162 156 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 CYTH3O43739 400 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 KPNA6O60684 536 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 GH1P01241 217 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 NR3C2P08235 984 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MMP3P08254 477 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 FOSL2P15408 326 aa8.54□□□□□ -1.04
TNNT3-211ENST00000453458 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms