RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451156.1

TRPS1-205, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRPS1, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-205ENST00000451156 BEX3Q00994 111 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 SCFD2Q8WU76 684 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 TOX2Q96NM4 488 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 REC8O95072 547 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PTGS1P23219 599 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 HSPA4P34932 840 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 CDK7P50613 346 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 FANCBQ8NB91 859 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 ZEB2O60315 1214 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 CABYRO75952 493 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 STXBP2Q15833 593 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 LRRC37A2A6NM11 1700 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 SLC34A2O95436 690 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PXMP2Q9NR77 195 aa25.09■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 NR3C2P08235 984 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 POLR2MP0CAP2 368 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 RXRAP19793 462 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.08■■□□□ 1.61
TRPS1-205ENST00000451156 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 ARVCFO00192 962 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CLTBP09497 229 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TTLL4Q14679 1199 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PPP2R5BQ15173 497 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 APOA5Q6Q788 366 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 KIAA0355O15063 1070 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 FAAP100Q0VG06 881 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CPT1AP50416 773 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 MICU3Q86XE3 530 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.05■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 A6NJR5 290 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 ZBTB43O43298 467 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 ARIH2O95376 493 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 COPS5Q92905 334 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 TDHQ8IZJ6 230 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 FBXL16Q8N461 479 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 GRIN2DO15399 1336 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 LAMA3Q16787 3333 aa25.03■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 KPNA6O60684 536 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 CPA1P15085 419 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 RCAN1P53805 252 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 ITGA7Q13683 1181 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 PGM5Q15124 567 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 BADQ92934 168 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 USP26Q9BXU7 913 aa25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRPS1-205ENST00000451156 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-205ENST00000451156 PIK3CDO00329 1044 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-205ENST00000451156 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-205ENST00000451156 ITGB8P26012 769 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPS1-205ENST00000451156 PSMA5P28066 241 aa25.01■■□□□ 1.59
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