RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 HIPK3Q9H422 1215 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 SENP2Q9HC62 589 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 A6NJR5 290 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 KLRF2D3W0D1 207 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MYL3P08590 195 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 IL23AQ9NPF7 189 aa23.44■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 B4DLN1 442 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 E7EWF7 191 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 GHRHRQ02643 423 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 TRDNQ13061 729 aa23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF365Q70YC5 407 aa23.43■■□□□ 1.34
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HLA-B-250ENST00000434333 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.43■■□□□ 1.34
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HLA-B-250ENST00000434333 TTLL4Q14679 1199 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 GRM4Q14833 912 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MAP4K1Q92918 833 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 VWCEQ96DN2 955 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 RMDN3Q96TC7 470 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 AMNQ9BXJ7 453 aa23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB5O15062 677 aa23.41■■□□□ 1.34
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HLA-B-250ENST00000434333 CCL23P55773 120 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 ANTXR2P58335 489 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 MYLIPQ8WY64 445 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 IWS1Q96ST2 819 aa23.41■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 CFBP00751 764 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 TROAPQ12815 778 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 CHST3Q7LGC8 479 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 NCOA7Q8NI08 942 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 HERVK_113Q902F9 699 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 PXMP2Q9NR77 195 aa23.4■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 CYTH3O43739 400 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 CYP2C9P11712 490 aa23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 WTAPQ15007 396 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 AFG1LQ8WV93 481 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 SCLYQ96I15 445 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PIGSQ96S52 555 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PBX4Q9BYU1 374 aa23.38■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 FGBP02675 491 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 NR3C2P08235 984 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 MMP3P08254 477 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PBX2P40425 430 aa23.37■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 HOMER1Q86YM7 354 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.37■■□□□ 1.33
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HLA-B-250ENST00000434333 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 GRIN2CQ14957 1233 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 TIFAQ96CG3 184 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 GBF1Q92538 1859 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 DLL1O00548 723 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 RGS20O76081 388 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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