RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 KCNAB2Q13303 367 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 CCDC103Q8IW40 242 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 NETO2Q8NC67 525 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.6□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 DPF3Q92784 378 aa8.6□□□□□ -1.03
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TTC27-202ENST00000428527 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.6□□□□□ -1.03
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TTC27-202ENST00000428527 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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TTC27-202ENST00000428527 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC27-202ENST00000428527 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.59□□□□□ -1.03
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TTC27-202ENST00000428527 PEX11GQ96HA9 241 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.57□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.57□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.56□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.55□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 SLC9A5Q14940 896 aa8.54□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 NBPF4Q96M43 638 aa8.54□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 MC3RP41968 323 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 FBLN7Q53RD9 439 aa8.53□□□□□ -1.04
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TTC27-202ENST00000428527 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 PWWP2AQ96N64 755 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC27-202ENST00000428527 PRODHO43272 600 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC27-202ENST00000428527 ATF2P15336 505 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC27-202ENST00000428527 MROH9Q5TGP6 573 aa8.52□□□□□ -1.05
TTC27-202ENST00000428527 USP53Q70EK8 1073 aa8.52□□□□□ -1.05
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