RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	MCM5	P33992	734 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	GHRHR	Q02643	423 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP2R5B	Q15173	497 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CASC1	Q6TDU7	716 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	IWS1	Q96ST2	819 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	GRIN2D	O15399	1336 aa		34.5	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	34.49	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	HSD17B4	P51659	736 aa		34.49	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	34.49	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		34.49	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TIMP1	P01033	207 aa		34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	ITGA7	Q13683	1181 aa		34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	MAP3K14	Q99558	947 aa		34.48	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CD4	P01730	458 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CPT1A	P50416	773 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TRAF1	Q13077	416 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TTLL4	Q14679	1199 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	COPS5	Q92905	334 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM87B	Q96K49	555 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	34.47	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	DDAH1	O94760	285 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	EPHB4	P54760	987 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	PSMC6	P62333	389 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	STXBP2	Q15833	593 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	MYL10	Q9BUA6	226 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	PXMP2	Q9NR77	195 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		34.46	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	ARIH2	O95376	493 aa		34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	FPGS	Q05932	587 aa		34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	TMTC2	Q8N394	836 aa		34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	34.45	■■■■□ 3.11
CIZ1-209	ENST00000420484	CDC45	O75419	566 aa		34.44	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	34.44	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		34.44	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	34.44	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484		A6NJR5	290 aa		34.43	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	NR3C2	P08235	984 aa		34.43	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	MYL3	P08590	195 aa		34.43	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		34.43	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC69	A6NI79	296 aa		34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	KIF5B	P33176	963 aa		34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	LIFR	P42702	1097 aa		34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	RNF20	Q5VTR2	975 aa		34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	MFSD5	Q6N075	450 aa		34.42	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	34.41	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	DEFB123	Q8N688	67 aa		34.41	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		34.41	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		34.41	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	SMARCA1	P28370	1054 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	LY6K	Q17RY6	165 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484		Q7L0L9	218 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		34.4	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	34.39	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	POLR2M	P0CAP2	368 aa		34.39	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		34.39	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		34.39	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		34.39	■■■■□ 3.1
CIZ1-209	ENST00000420484	B4GALT4	O60513	344 aa		34.38	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	KPNA6	O60684	536 aa		34.38	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	GH1	P01241	217 aa		34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGAP1	Q07960	439 aa		34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		34.37	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CALM1	P0DP23	149 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CALM2	P0DP24	149 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CALM3	P0DP25	149 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RXRA	P19793	462 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CYP2C18	P33260	490 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	GNAQ	P50148	359 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	PGM5	Q15124	567 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM199	Q8N511	208 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	NEK1	Q96PY6	1258 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	CSF2RA	P15509	400 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	34.35	■■■■□ 3.09	3e-6	■■■■□ 24.1
CIZ1-209	ENST00000420484	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CIZ1-209	ENST00000420484	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		34.35	■■■■□ 3.09

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