RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.53■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.53■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL20A1Q9P218 1284 aa15.53■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.53■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LTBP2Q14767 1821 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFBP00751 764 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTLL4Q14679 1199 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOMER1Q86YM7 354 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMTC2Q8N394 836 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DEFB123Q8N688 67 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.52■□□□□ 0.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LCTP09848 1927 aa15.52■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.52■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GRIN2DO15399 1336 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC27A2O14975 620 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRC1O43663 620 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD4P01730 458 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MCM5P33992 734 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSD17B4P51659 736 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NECTIN1Q15223 517 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STXBP2Q15833 593 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MFSD5Q6N075 450 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SKAP1Q86WV1 359 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM87BQ96K49 555 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIGSQ96S52 555 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP3K14Q99558 947 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LY9Q9HBG7 655 aa15.51■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OPLAHO14841 1288 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYTH3O43739 400 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KPNA6O60684 536 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DDAH1O94760 285 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYL3P08590 195 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF5BP33176 963 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPHB4P54760 987 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMC6P62333 389 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PURAQ00577 322 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GHRHRQ02643 423 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 Q7L0L9 218 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PXMP2Q9NR77 195 aa15.5■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC69A6NI79 296 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 A6NJR5 290 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF20Q5VTR2 975 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM199Q8N511 208 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COPS5Q92905 334 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.49■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 B4GALT4O60513 344 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARIH2O95376 493 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NR3C2P08235 984 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR2MP0CAP2 368 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNAQP50148 359 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYL10Q9BUA6 226 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HIPK3Q9H422 1215 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.48■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDC45O75419 566 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GH1P01241 217 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CALM1P0DP23 149 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CALM2P0DP24 149 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CALM3P0DP25 149 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSF2RAP15509 400 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMARCA1P28370 1054 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LIFRP42702 1097 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LY6KQ17RY6 165 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PDCD2LQ9BRP1 358 aa15.47■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CYP2C18P33260 490 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms