RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 IL1R1P14778 569 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE6BP35913 854 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 TECP42680 631 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 CACNB3P54284 484 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 STK32BQ9NY57 414 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX11Q8IYF3 940 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MASTLQ96GX5 879 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 BICDL2A1A5D9 508 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND10O75800 440 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN2P17655 700 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBED6P86452 979 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP58Q9BVL2 599 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH1P12882 1939 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TULP2O00295 520 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF185O15231 689 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CAGE1Q8TC20 777 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CUEDC2Q9H467 287 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCO2A6NFE2 343 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 RASA1P20936 1047 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTN2P35609 894 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MIIPQ5JXC2 388 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 AK8Q96MA6 479 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YIN7 160 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 RETREG2Q8NC44 543 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71BQ8TC56 605 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 JADE2Q9NQC1 790 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 BAG3O95817 575 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 IDEP14735 1019 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 C21orf2O43822 256 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 AOC3Q16853 763 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 LTBP1Q14766 1721 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA3FQ13275 785 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK8Q86SG6 692 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf50Q9HD87 102 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TBCKQ8TEA7 893 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF263O14978 683 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH1B1P30837 517 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TXKP42681 527 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF5AQ12840 1032 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 POTEDQ86YR6 584 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC42Q96M95 316 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 HINFPQ9BQA5 517 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 AMPD3Q01432 767 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC96Q2M329 555 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 EYA3Q99504 573 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN9AQ15858 1988 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB7AO95365 584 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 RHBDL3P58872 404 aa20.77■□□□□ 0.92
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