RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394011.7

RALGPS1-206, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-206ENST00000394011 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 TMEM199Q8N511 208 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 SLC27A2O14975 620 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF365Q70YC5 407 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 MYLIPQ8WY64 445 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 COPS5Q92905 334 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 MAF1Q9H063 256 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 HIPK3Q9H422 1215 aa22.83■■□□□ 1.25
RALGPS1-206ENST00000394011 ABCB11O95342 1321 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 DNAJB2P25686 324 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PDE4DQ08499 809 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 NECTIN1Q15223 517 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 IL23AQ9NPF7 189 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 OPLAHO14841 1288 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 RNF20Q5VTR2 975 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SCFD2Q8WU76 684 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MTMR8Q96EF0 704 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SCN5AQ14524 2016 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 VCANP13611 3396 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 A6NJR5 290 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PBX2P40425 430 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 CPT1AP50416 773 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 GRIN2CQ14957 1233 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PPP2R5BQ15173 497 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 HERVK_113Q902F9 699 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PBX4Q9BYU1 374 aa22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 ERICH2A1L162 156 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 CCL23P55773 120 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 GHRHRQ02643 423 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 CHST3Q7LGC8 479 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.79■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MYL3P08590 195 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 FBXO11Q86XK2 927 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 SENP2Q9HC62 589 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.78■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 TIFAQ96CG3 184 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 ZNF576Q9H609 170 aa22.77■■□□□ 1.24
RALGPS1-206ENST00000394011 REC8O95072 547 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 CYP2C9P11712 490 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 HSD17B4P51659 736 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 TTLL4Q14679 1199 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 WTAPQ15007 396 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 SCLYQ96I15 445 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.76■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 B4DLN1 442 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 KLRF2D3W0D1 207 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 FGBP02675 491 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 MCM5P33992 734 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 ANTXR2P58335 489 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 ARHGAP1Q07960 439 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 LY6KQ17RY6 165 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 IWS1Q96ST2 819 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 RMDN3Q96TC7 470 aa22.75■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 PRC1O43663 620 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 KPNA6O60684 536 aa22.74■■□□□ 1.23
RALGPS1-206ENST00000394011 FOSL2P15408 326 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms