RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 HOMER1Q86YM7 354 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 APPBP2Q92624 585 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRN2Q92932 1015 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 MTA3Q9BTC8 594 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 FANCLQ9NW38 375 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO1BO43795 1136 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 C8AP07357 584 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TACR1P25103 407 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL4AP40617 200 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL6P41182 706 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 GABREP78334 506 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 LSAMPQ13449 338 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 LZTR1Q8N653 840 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 BTG4Q9NY30 223 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQJ5 194 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ASMTLO95671 621 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 FUCA1P04066 466 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 SDHBP21912 280 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2A2P52657 109 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVFRD-1P60508 538 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR85P60893 370 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 SDE2Q6IQ49 451 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 LBX2Q6XYB7 198 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP68Q76N32 757 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 C22orf46C9J442 243 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 AQP7O14520 342 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ENPP3O14638 875 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PLD2O14939 933 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC45O75419 566 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 RAPGEF3O95398 923 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 FPR2P25090 351 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM61Q5EBN2 209 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRF1Q5T601 910 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 BICRALQ6AI39 1079 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf86Q6ZW13 317 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP10Q86W26 655 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8N1Y9 231 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTCDQ8NEC7 633 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 USP33Q8TEY7 942 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM169Q96HH4 297 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 CDIP1Q9H305 208 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 H7BY64 318 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNQ2O43526 872 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 EFCAB14O75071 495 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 DBHP09172 617 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 GLI4P10075 376 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE6BP35913 854 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TCEA2Q15560 299 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CLDND1Q9NY35 253 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 X6R8D5 127 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 OR14I1A6ND48 311 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SRGAP3O43295 1099 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 CRTAMO95727 393 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 NTRK1P04629 796 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 MPOP05164 745 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCY1A3Q02108 690 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 KIZQ2M2Z5 673 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-202ENST00000370826 TKFCQ3LXA3 575 aa5.7□□□□□ -1.5
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