RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369762.6

ATP6AP1-201, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP6AP1, Length 2,099 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-201ENST00000369762 RAD54LQ92698 747 aa23.58■■□□□ 1.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.58■■□□□ 1.37
ATP6AP1-201ENST00000369762 POTEMA6NI47 508 aa23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MCM6Q14566 821 aa23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 HAS1Q92839 578 aa23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.58■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CENPPQ6IPU0 288 aa23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CARD6Q9BX69 1037 aa23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.57■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TTC26A0AVF1 554 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SLC1A4P43007 532 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SLFN13Q68D06 897 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 DNAJC7Q99615 494 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 OGFRQ9NZT2 677 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 KIF5CO60282 957 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 UBXN4Q92575 508 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 LZTFL1Q9NQ48 299 aa23.56■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 FAM196BA6NMK8 535 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CNKSR1Q969H4 720 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SLC26A4O43511 780 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 HYIQ5T013 277 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 RETREG2Q8NC44 543 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 NUP58Q9BVL2 599 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.55■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 B4DLN1 442 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 USP11P51784 963 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 EHHADHQ08426 723 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 PSMD2Q13200 908 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.54■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 A0A0U1RQJ8 604 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ICA1Q05084 483 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SEPT2Q15019 361 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MBOAT7Q96N66 472 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ENTPD3O75355 529 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CYP3A7P24462 503 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 CBX1P83916 185 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MIIPQ5JXC2 388 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 KCNK18Q7Z418 384 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 HPS3Q969F9 1004 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 GMCL1Q96IK5 515 aa23.53■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MCTP2Q6DN12 878 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ATP6AP1-201ENST00000369762 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 ARHGAP25P42331 645 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 AP3B2Q13367 1082 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 TUBB2AQ13885 445 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 ECM1Q16610 540 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 MEA1Q16626 185 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 AOC3Q16853 763 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 FIGNQ5HY92 759 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 DDX12PQ92771 950 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 CHP1Q99653 195 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 ABCB11O95342 1321 aa23.51■■□□□ 1.35
ATP6AP1-201ENST00000369762 USP17L15C9J2P7 530 aa23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms