RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 B4GALT3O60512 393 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 ITGA4P13612 1032 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 9.2
PTPRC-202ENST00000367364 STK32CQ86UX6 486 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 FAM124AQ86V42 546 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 CBFA2T2O43439 604 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 KLF10Q13118 480 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 GGT7Q9UJ14 662 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WZG4 1122 aa7.61□□□□□ -1.19
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PTPRC-202ENST00000367364 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 31.5
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PTPRC-202ENST00000367364 ITGA1P56199 1179 aa7.6□□□□□ -1.19
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PTPRC-202ENST00000367364 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
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PTPRC-202ENST00000367364 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 MIB1Q86YT6 1006 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 PALM2Q8IXS6 379 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 TTLL6Q8N841 843 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 TM9SF2Q99805 663 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-202ENST00000367364 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 VAMP4O75379 141 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 SURF1Q15526 300 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 USP33Q8TEY7 942 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 MBD6Q96DN6 1003 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 C7orf72A4D263 438 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 C9orf118A6NHY6 69 aa7.56□□□□□ -1.2
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PTPRC-202ENST00000367364 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-202ENST00000367364 SGSM2O43147 1006 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-202ENST00000367364 GUCY2CP25092 1073 aa7.55□□□□□ -1.2
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PTPRC-202ENST00000367364 TCEAL1Q15170 157 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 WHRNQ9P202 907 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 PAMP19021 973 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM9Q13443 819 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 MBLAC2Q68D91 279 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.54□□□□□ -1.2
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PTPRC-202ENST00000367364 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 HAUS7Q99871 368 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 ITGAEP38570 1179 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 DPF3Q92784 378 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 SPON2Q9BUD6 331 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 DEF6Q9H4E7 631 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-202ENST00000367364 PATE3B3GLJ2 98 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 PTPN18Q99952 460 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF34Q969K3 372 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 TGM1P22735 817 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2CBP62714 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2CAP67775 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-202ENST00000367364 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.5□□□□□ -1.21
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