RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 GJA10Q969M2 543 aa22.13■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 Q9H521 79 aa22.13■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 BRD1O95696 1058 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 CYP4A11Q02928 519 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.12■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 MED7O43513 233 aa22.12■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.12■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 SAT1P21673 171 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 PDE1BQ01064 536 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 APBA1Q02410 837 aa22.11■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 LRRC24Q50LG9 513 aa22.11■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 DPH5Q9H2P9 285 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 STX1BP61266 288 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 IL17REQ8NFR9 667 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.09■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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SMURF1-202ENST00000361368 LRGUKQ96M69 825 aa22.08■■□□□ 1.13
SMURF1-202ENST00000361368 PHKA1P46020 1223 aa22.08■■□□□ 1.12
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SMURF1-202ENST00000361368 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 FAM160B2Q86V87 743 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 NLRP7Q8WX94 980 aa22.08■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 CEP170P1Q96L14 293 aa22.08■■□□□ 1.12
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SMURF1-202ENST00000361368 PTH1RQ03431 593 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 RAPH1Q70E73 1250 aa22.07■■□□□ 1.12
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SMURF1-202ENST00000361368 NR2F2P24468 414 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 COG7P83436 770 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 ABCC12Q96J65 1359 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 WDR64B1ANS9 1081 aa22.07■■□□□ 1.12
SMURF1-202ENST00000361368 MYL1P05976 194 aa22.07■■□□□ 1.12
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