RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 ESYT2A0FGR8 921 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 ENC1O14682 589 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 NDUFA10O95299 355 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 MYL1P05976 194 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 NPR1P16066 1061 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR59Q6PJI9 974 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.66■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 GDF11O95390 407 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 SMARCA1P28370 1054 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 AMPD3Q01432 767 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 CUEDC2Q9H467 287 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 RASSF10A6NK89 507 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM51Q9NW97 253 aa21.65■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX12PQ92771 950 aa21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 LTBP1Q14766 1721 aa21.64■■□□□ 1.06
TM7SF3-201ENST00000343028 CTAGE9A4FU28 777 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM14Q14142 442 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 HAS1Q92839 578 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FOCADQ5VW36 1801 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB5O15062 677 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 APBA3O96018 575 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 DNM2P50570 870 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CHMP4BP1P59074 171 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 MIIPQ5JXC2 388 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 KRT79Q5XKE5 535 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CUL5Q93034 780 aa21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH4Q9Y623 1939 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FECHP22830 423 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC1A4P43007 532 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CYP27A1Q02318 531 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SEPT2Q15019 361 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 TAF3Q5VWG9 929 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SWAP70Q9UH65 585 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 BICDL2A1A5D9 508 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 USH1GQ495M9 461 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.63■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA1Q92805 767 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 EPHB6O15197 1021 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CHRNA5P30532 468 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 ALDH1B1P30837 517 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 STAT3P40763 770 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.62■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 HERVK_113P62684 666 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 TMC4Q7Z404 712 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RAD54LQ92698 747 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 CDC23Q9UJX2 597 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 E9PMD0 336 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 DNAJC7Q99615 494 aa21.61■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A1W2PQC6 194 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 RCCD1A6NED2 376 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SASH3O75995 380 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.6■■□□□ 1.05
TM7SF3-201ENST00000343028 SRGAP2O75044 1071 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms