RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 RASSF10A6NK89 507 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM196BA6NMK8 535 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KIF5CO60282 957 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ABL1P00519 1130 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP2B2Q01814 1243 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MIIPQ5JXC2 388 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNK18Q7Z418 384 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 MKL1Q969V6 931 aa23.21■■□□□ 1.31
KCNQ1-202ENST00000335475 EHHADHQ08426 723 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 CENPPQ6IPU0 288 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 OR8K1Q8NGG5 319 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB34Q9BZG1 259 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR59Q6PJI9 974 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NYAP2Q9P242 653 aa23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ECM1Q16610 540 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MSL1Q68DK7 614 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 EEF2KMTQ96G04 330 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TCP10Q12799 353 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MEA1Q16626 185 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KRT79Q5XKE5 535 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF4Q8WV16 495 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ECE2O60344 883 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.18■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFA10O95299 355 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 APBA3O96018 575 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 HYIQ5T013 277 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35F6Q8N357 371 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KLK7P49862 253 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 STYK1Q6J9G0 422 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DYMQ7RTS9 669 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 GJA10Q969M2 543 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 RETREG2Q8NC44 543 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 PSME4Q14997 1843 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SLFN13Q68D06 897 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 CDC23Q9UJX2 597 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.16■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC1A4P43007 532 aa23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 SEPT2Q15019 361 aa23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX12PQ92771 950 aa23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP58Q9BVL2 599 aa23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 EPC1Q9H2F5 836 aa23.15■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L15C9J2P7 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L11C9JVI0 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L18D6R9N7 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L22D6RA61 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L19D6RCP7 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L20D6RJB6 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 HERVK_113P62684 666 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L24Q0WX57 530 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 FIGNQ5HY92 759 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 MBOAT7Q96N66 472 aa23.14■■□□□ 1.3
KCNQ1-202ENST00000335475 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms