RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330070.5

HOXB2-201, Transcript of homeobox B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB2, Length 1,562 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2-201ENST00000330070 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 SCFD2Q8WU76 684 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 DPF3Q92784 378 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 CUL5Q93034 780 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PGK1P00558 417 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 C8orf34Q49A92 452 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PHF24Q9UPV7 400 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB2-201ENST00000330070 ADCY6O43306 1168 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 NR3C2P08235 984 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SMPD1P17405 629 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ANKRD1Q15327 319 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 EVI5O60447 810 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 TLK2Q86UE8 772 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SEC24BO95487 1268 aa23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 TTLL4Q14679 1199 aa23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 C1orf53Q5VUE5 145 aa23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 MEIS2O14770 477 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 STAM2O75886 525 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PGM5Q15124 567 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 BARHL2Q9NY43 387 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ZEB2O60315 1214 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 IFNAR1P17181 557 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CCND2P30279 289 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ACLYP53396 1101 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 NAPAP54920 295 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SNX17Q15036 470 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 NTRK3Q16288 839 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 GNASQ5JWF2 1037 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CTAGE5O15320 804 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SCG2P13521 617 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 KCNA10Q16322 511 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ALPK3Q96L96 1907 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ELP1O95163 1332 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 A0A1W2PQY0 241 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 STXBP3O00186 592 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CABYRO75952 493 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB2-201ENST00000330070 ESYT2A0FGR8 921 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB2-201ENST00000330070 MYADML2A6NDP7 307 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms