RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 USP6NLQ92738 828 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 EYA1Q99502 592 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 AGXT2Q9BYV1 514 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MRFAP1Q9Y605 127 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SQORQ9Y6N5 450 aa10.13□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 H0YHG0 523 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DTNBO60941 627 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TMCC2O75069 709 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 KRT38O76015 456 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 YEATS4O95619 227 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 OSBPP22059 807 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GRK2P25098 689 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TXLNAP40222 546 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 APBA1Q02410 837 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SCRN1Q12765 414 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MLC1Q15049 377 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CFAP58Q5T655 872 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 AACSQ86V21 672 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 IL17REQ8NFR9 667 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 USP6P35125 1406 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 A0A0D9SFI3 127 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 C2orf81A6NN90 581 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 STX10O60499 249 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRDNQ13061 729 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PTGDRQ13258 359 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 INF2Q27J81 1249 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 LILRB2Q8N423 598 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TCHPQ9BT92 498 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 FSD1Q9BTV5 496 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TMEM260Q9NX78 707 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TTLL3Q9Y4R7 772 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 NCAPD2Q15021 1401 aa10.12□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ABCC6O95255 1503 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TYRP1P17643 537 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SERPINB3P29508 390 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GABREP78334 506 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 FAAH2Q6GMR7 532 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TMC7Q7Z402 723 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 VSTM4Q8IW00 320 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 FBXL16Q8N461 479 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TRPM4Q8TD43 1214 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 NACC2Q96BF6 587 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 TCEANC2Q96MN5 208 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 UTYO14607 1347 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 MUSKO15146 869 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 ERLIN1O75477 346 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GUCY2CP25092 1073 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.11□□□□□ -0.79
MMP3-201ENST00000299855 BTN2A1Q7KYR7 527 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms