RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 RCN2Q14257 317 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CUL4AQ13619 759 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RPAINQ86UA6 219 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 HESX1Q9UBX0 185 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1FO00160 1098 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCN6P51797 869 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PLTPP55058 493 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNDQ07001 517 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 HAUS8Q9BT25 410 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCY1Q08828 1119 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN2A1Q16706 1144 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ODR4Q5SWX8 454 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 VSTM4Q8IW00 320 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC43Q8N309 656 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO3Q9BYT9 981 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ADORA1P30542 326 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ASPHQ12797 758 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NNTQ13423 1086 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP11Q8WWU5 503 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CSRNP1Q96S65 589 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PHKG2P15735 406 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 POLA2Q14181 598 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 AK8Q96MA6 479 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 COPRSQ9NQ92 184 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F5Q15329 346 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.29■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCR5P32302 372 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZD8Q8NEN9 1154 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 POMGNT1Q8WZA1 660 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1B1P30837 517 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MCF2L2Q86YR7 1114 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NT5C1BQ96P26 610 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ECE1P42892 770 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFB4P59827 614 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1ARQ63HQ0 302 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP7Q8WX94 980 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SDCCAG3Q96C92 435 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX1Q13596 522 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED2Q15363 201 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PHKA1P46020 1223 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC41Q15345 812 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.28■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ECEL1O95672 775 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 FTCDO95954 541 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE6BP35913 854 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR70Q9NW82 654 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ICA1Q05084 483 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC151A5D8V7 595 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CIAO1O76071 339 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF653Q96CK0 615 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDL1Q96EA4 605 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 A6NJR5 290 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK4P31152 587 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SGO2Q562F6 1265 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC4Q96A65 974 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM11Q96F44 468 aa26.27■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE1BQ01064 536 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP7D3Q8IWC1 876 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC11Q96DB2 347 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 STK32BQ9NY57 414 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 JRKLQ9Y4A0 524 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRL2O95490 1459 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFN13Q68D06 897 aa26.26■■□□□ 1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms