RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 RAD54LQ92698 747 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC7Q99615 494 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ESYT2A0FGR8 921 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 STXBP3O00186 592 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 CDK17Q00537 523 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ITPK1Q13572 414 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 MTMR3Q13615 1198 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R5EQ16537 467 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ALS2CLQ60I27 953 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 GPBP1Q86WP2 473 aa9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
HERC3-201ENST00000264345 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MYZAPP0CAP1 466 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KA1Q15418 735 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KIFC2Q96AC6 838 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TRIM37O94972 964 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ADRA2BP18089 450 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CDC25AP30304 524 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DNA2P51530 1060 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KIF11P52732 1056 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CROCCP2Q86T23 111 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 USP40Q9NVE5 1235 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CEP72Q9P209 647 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 POTEJP0CG39 1038 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SLC1A4P43007 532 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FIGNQ5HY92 759 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 POTEDQ86YR6 584 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TRIM9Q9C026 710 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 F8W031 263 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G4AP47712 749 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 EMBQ6PCB8 327 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 USP37Q86T82 979 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PLVAPQ9BX97 442 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ENC1O14682 589 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 E2F4Q16254 413 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TXNRD1Q16881 649 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PPM1EQ8WY54 764 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 IFT81Q8WYA0 676 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TEKT1Q969V4 418 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.76□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RNF40O75150 1001 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ALDH1B1P30837 517 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ARID5AQ03989 594 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D8O95759 1140 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GAP43P17677 238 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 COL18A1P39060 1754 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 BMP6P22004 513 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 CETN2P41208 172 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 AP3B2Q13367 1082 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ADAM9Q13443 819 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 WDR93Q6P2C0 686 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 PBKQ96KB5 322 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 INTS13Q9NVM9 706 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 RIMBP2O15034 1052 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 DCAF4Q8WV16 495 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 MXD3Q9BW11 206 aa9.75□□□□□ -0.85
HERC3-201ENST00000264345 SH2D4AQ9H788 454 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms