RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 MYH6P13533 1939 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 ITGB8P26012 769 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 SMARCA1P28370 1054 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 TRAF1Q13077 416 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 RNF20Q5VTR2 975 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 RMDN3Q96TC7 470 aa25.82■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 ZEB2O60315 1214 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 HOMER1Q86YM7 354 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 BADQ92934 168 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 TBX21Q9UL17 535 aa25.81■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CFBP00751 764 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 PPP2R5BQ15173 497 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 GRIN2DO15399 1336 aa25.8■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 KIF5BP33176 963 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 LRCH3Q96II8 777 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 MYL10Q9BUA6 226 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 PXMP2Q9NR77 195 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.79■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 ARIH2O95376 493 aa25.78■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 GPR153Q6NV75 609 aa25.78■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 RASEFQ8IZ41 740 aa25.78■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.78■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.78■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 A6NJR5 290 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CD4P01730 458 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CPT1AP50416 773 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 TTLL4Q14679 1199 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 STXBP2Q15833 593 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 NEK1Q96PY6 1258 aa25.77■■□□□ 1.72
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC69A6NI79 296 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 NR3C2P08235 984 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 CALM1P0DP23 149 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 CALM2P0DP24 149 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 CALM3P0DP25 149 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 RAG1P15918 1043 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 GNAQP50148 359 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 ITGA7Q13683 1181 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 COPS5Q92905 334 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 KCNB2Q92953 911 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.76■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 TIMP1P01033 207 aa25.75■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.75■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.75■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 NEFLP07196 543 aa25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 POLR2MP0CAP2 368 aa25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.74■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 KRT32Q14532 448 aa25.73■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 SHHQ15465 462 aa25.73■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.73■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.73■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 KPNA6O60684 536 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 RGS20O76081 388 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 RXRAP19793 462 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 EPHB4P54760 987 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 PSMC6P62333 389 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP1Q07960 439 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 FANCBQ8NB91 859 aa25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 PGM5Q15124 567 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 LY6KQ17RY6 165 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 MFSD5Q6N075 450 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 APOA5Q6Q788 366 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 IL31RAQ8NI17 732 aa25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PRADC1-201ENST00000258083 GH1P01241 217 aa25.7■■□□□ 1.7
PRADC1-201ENST00000258083 HSPA4P34932 840 aa25.7■■□□□ 1.7
PRADC1-201ENST00000258083 FPGSQ05932 587 aa25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms