RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 CD209Q9NNX6 404 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 PTPROQ16827 1216 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 RETREG2Q8NC44 543 aa20.47■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 LRP6O75581 1613 aa20.47■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 RNF40O75150 1001 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 SCNN1DP51172 638 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 CERS3Q8IU89 383 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC7Q99615 494 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R2P41236 205 aa20.46■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.46■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 IFT81Q8WYA0 676 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 KIF11P52732 1056 aa20.46■□□□□ 0.87
LRP3-201ENST00000253193 USP14P54578 494 aa20.46■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.46■□□□□ 0.87
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LRP3-201ENST00000253193 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.45■□□□□ 0.86
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LRP3-201ENST00000253193 GPSM2P81274 684 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ACTN2P35609 894 aa20.45■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 FAM71BQ8TC56 605 aa20.45■□□□□ 0.86
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LRP3-201ENST00000253193 NUP98P52948 1817 aa20.44■□□□□ 0.86
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LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 NCK2O43639 380 aa20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 MAN2A1Q16706 1144 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 RAB21Q9UL25 225 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 DISP2A7MBM2 1401 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TCP10Q12799 353 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SPAG5Q96R06 1193 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 PANK4Q9NVE7 773 aa20.43■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
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LRP3-201ENST00000253193 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.42■□□□□ 0.86
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LRP3-201ENST00000253193 IVLP07476 585 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TAF4BQ92750 862 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 NOX5Q96PH1 765 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 POLD4Q9HCU8 107 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 SLIT2O94813 1529 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 FLT1P17948 1338 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 ZNF76P36508 570 aa20.42■□□□□ 0.86
LRP3-201ENST00000253193 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.42■□□□□ 0.86
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