RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.29■■□□□ 1.48
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CITED1-201ENST00000246139 CABYRO75952 493 aa24.28■■□□□ 1.48
CITED1-201ENST00000246139 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CITED1-201ENST00000246139 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.28■■□□□ 1.48
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CITED1-201ENST00000246139 MAP3K14Q99558 947 aa24.27■■□□□ 1.48
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CITED1-201ENST00000246139 KIF5BP33176 963 aa24.25■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 PPP2R5BQ15173 497 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 SCFD2Q8WU76 684 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 NEK1Q96PY6 1258 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 COL20A1Q9P218 1284 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.25■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.24■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF16Q5VV41 709 aa24.24■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.23■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 CALM2P0DP24 149 aa24.22■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 CALM3P0DP25 149 aa24.22■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 IWS1Q96ST2 819 aa24.22■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 TBX21Q9UL17 535 aa24.22■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 KRT32Q14532 448 aa24.21■■□□□ 1.47
CITED1-201ENST00000246139 MYLIPQ8WY64 445 aa24.21■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.21■■□□□ 1.47
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CITED1-201ENST00000246139 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.2■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.2■■□□□ 1.46
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CITED1-201ENST00000246139 TTC28Q96AY4 2481 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 GRIN2DO15399 1336 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED1-201ENST00000246139 MFSD5Q6N075 450 aa24.19■■□□□ 1.46
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