RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cabp7Q91ZM8 215 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sgpp1Q9JI99 430 aa32.44■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sbf2E9PXF8 1872 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp8b5A3FIN4 1183 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Neurl1bQ0MW30 546 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fdxacb1Q3UY23 622 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Appl2Q8K3G9 662 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 E2f4Q8R0K9 410 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Brms1Q99N20 246 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pex3Q9QXY9 372 aa32.43■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A0A1L1SQF0 893 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam184aE9PW83 1143 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt78E9Q0F0 1068 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Magea8O89012 320 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PtmaP26350 111 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Meis1Q60954 390 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt82Q99M74 516 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Saal1Q9D2C2 474 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NapaQ9DB05 295 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Disp2Q8CIP5 1345 aa32.42■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pik3r1P26450 724 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10392Q3V3I3 114 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RragbQ6NTA4 374 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pgm5Q8BZF8 567 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CrygnQ8VHL5 183 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mkrn1Q9QXP6 481 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cntnap5cQ0V8T7 1305 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 OsbpQ3B7Z2 805 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GypcQ78HU7 95 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P2ry10Q8BFU7 328 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep128Q8BI22 1102 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef19Q8BWA8 802 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myt1Q8CFC2 1127 aa32.41■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Barx2O08686 283 aa32.4■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf219Q6IQX8 726 aa32.4■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc17a8Q8BFU8 601 aa32.4■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Alpk1Q9CXB8 1231 aa32.4■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pgap3A2A559 320 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itgb5O70309 798 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SfnO70456 248 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrgprb1Q3UG61 350 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4933427I04RikQ3V053 235 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gba2Q69ZF3 918 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fermt2Q8CIB5 680 aa32.39■■■□□ 2.78
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stx1aO35526 288 aa32.38■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klhl34A2AI76 644 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cfap73J3QPZ5 306 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SelpQ01102 768 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc7a1Q09143 622 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfm4Q3UZZ4 505 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pde5aQ8CG03 865 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt79Q8VED5 531 aa32.37■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Msh3P13705 1091 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp25P57080 1055 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc36Q3V0M2 755 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snx13Q6PHS6 957 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CnstQ8CBC4 711 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q91WD4 421 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gcnt4E9Q649 455 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4758L7N258 96 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gjd2O54851 321 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GclcP97494 637 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp17leQ7M764 540 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa32.36■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PfasQ5SUR0 1337 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stim2P83093 746 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Polr3gQ6NXY9 223 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem132dQ76HP3 1097 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clic6Q8BHB9 596 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 UtrnE9Q6R7 3430 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc6G3UYY4 1857 aa32.35■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oip5A2AQ14 241 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hoxc13P50207 328 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adamts10P58459 1104 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rit2P70425 217 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Coa7Q921H9 231 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plagl1Q9JLQ4 704 aa32.34■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tdo2P48776 406 aa32.33■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kansl1lQ5DTI6 991 aa32.33■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ces4aQ8R0W5 563 aa32.33■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akr1c19G3X9Y6 323 aa32.32■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc162pQ0VG85 912 aa32.32■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mettl14Q3UIK4 456 aa32.32■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sun3Q5SS91 320 aa32.32■■■□□ 2.77
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.6 ms