RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam83hQ148V8 1209 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pde5aQ8CG03 865 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Anapc4Q91W96 807 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scn10aQ6QIY3 1958 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc173A0JLY1 547 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc27A2A6Q5 825 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Oip5A2AQ14 241 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam184aE9PW83 1143 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcna3P16390 528 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atoh1P48985 351 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Traf5P70191 558 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 E2f4Q8R0K9 410 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DaglbQ91WC9 669 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 EhhadhQ9DBM2 718 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eps15P42567 897 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BcrQ6PAJ1 1270 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep128Q8BI22 1102 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DnerQ8JZM4 737 aa14.67□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm4758L7N258 96 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ArP19091 899 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sox10Q04888 466 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Meis1Q60954 390 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nlgn2Q69ZK9 836 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cep135Q6P5D4 1140 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem132dQ76HP3 1097 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Senp7Q8BUH8 1037 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q91WD4 421 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arl6ip4Q9JM93 229 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc25aP48964 514 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ngly1Q9JI78 651 aa14.66□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpina16D3Z660 418 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hmx1O70218 332 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tab2Q99K90 693 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mroh8E9PYI4 1049 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tal1P22091 329 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8BZJ8 459 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc27Q8CD92 847 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mov10l1Q99MV5 1187 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cnpy2Q9QXT0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zscan25B2RX31 543 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mpp3O88910 568 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mcm6P97311 821 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim47Q8C0E3 641 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ifih1Q8R5F7 1025 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adcy5P84309 1262 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdr70Q3TWF6 657 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Txndc16Q7TN22 820 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcnv2Q8CFS6 562 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Erich6bQ9D4S6 220 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NefhP19246 1090 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Setd4P58467 439 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mettl14Q3UIK4 456 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc122Q8BVN0 290 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stard7Q8R1R3 373 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vav3Q9R0C8 847 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eif2ak1Q9Z2R9 619 aa14.64□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Armc3A2AU72 881 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ddx19bQ8BZY3 494 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IrgqQ8VIM9 583 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5737A0A140LI11 423 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Esr2O08537 530 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Serpinb2P12388 415 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tdo2P48776 406 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Neurl1bQ0MW30 546 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Bcas3Q8CCN5 928 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam83aQ8K2P2 436 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Brms1Q99N20 246 aa14.63□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5624F6ZZG8 207 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Itgb5O70309 798 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc162pQ0VG85 912 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gas7Q60780 421 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Josd2Q9CR30 188 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcnh7Q9ER47 1195 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Asic1Q6NXK8 526 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fermt2Q8CIB5 680 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt79Q8VED5 531 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rexo5D3YW29 759 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HunkO88866 714 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc7a1Q09143 622 aa14.62□□□□□ -0.07
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28 ms