RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.44■■■■□ 3.42
SRRT-218ENST00000620394 PLCH2O75038 1416 aa36.43■■■■□ 3.42
SRRT-218ENST00000620394 FMN1Q68DA7 1419 aa36.41■■■■□ 3.42
SRRT-218ENST00000620394 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.4■■■■□ 3.42
SRRT-218ENST00000620394 HSPA2P54652 639 aa36.37■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.35■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.34■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.33■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.33■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.32■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 ATP10AO60312 1499 aa36.32■■■■□ 3.41
SRRT-218ENST00000620394 KIF14Q15058 1648 aa36.31■■■■□ 3.4
SRRT-218ENST00000620394 MLECQ14165 292 aa36.29■■■■□ 3.4
SRRT-218ENST00000620394 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.25■■■■□ 3.39
SRRT-218ENST00000620394 KDM5CP41229 1560 aa36.24■■■■□ 3.39
SRRT-218ENST00000620394 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.23■■■■□ 3.39
SRRT-218ENST00000620394 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.21■■■■□ 3.39
SRRT-218ENST00000620394 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.19■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 CLIP1P30622 1438 aa36.16■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 CERKQ8TCT0 537 aa36.15■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 REREQ9P2R6 1566 aa36.15■■■■□ 3.38
SRRT-218ENST00000620394 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.13■■■■□ 3.37
SRRT-218ENST00000620394 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.08■■■■□ 3.37
SRRT-218ENST00000620394 ABCA6Q8N139 1617 aa36.07■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 PREX2Q70Z35 1606 aa36.06■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 STRCQ7RTU9 1775 aa36.06■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.06■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.06■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.01■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 ABCC1P33527 1531 aa36.01■■■■□ 3.36
SRRT-218ENST00000620394 C3P01024 1663 aa36■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 AFAP1Q8N556 730 aa36■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 AGLP35573 1532 aa35.98■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.97■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.96■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.95■■■■□ 3.35
SRRT-218ENST00000620394 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.88■■■■□ 3.34
SRRT-218ENST00000620394 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.88■■■■□ 3.33
SRRT-218ENST00000620394 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.88■■■■□ 3.33
SRRT-218ENST00000620394 PTPRTO14522 1441 aa35.84■■■■□ 3.33
SRRT-218ENST00000620394 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.83■■■■□ 3.33
SRRT-218ENST00000620394 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
SRRT-218ENST00000620394 MROH2AA6NES4 1674 aa35.79■■■■□ 3.32
SRRT-218ENST00000620394 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.76■■■■□ 3.31
SRRT-218ENST00000620394 NCOA1Q15788 1441 aa35.71■■■■□ 3.31
SRRT-218ENST00000620394 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.7■■■■□ 3.31
SRRT-218ENST00000620394 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.7■■■■□ 3.31
SRRT-218ENST00000620394 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.69■■■■□ 3.3
SRRT-218ENST00000620394 NPATQ14207 1427 aa35.69■■■■□ 3.3
SRRT-218ENST00000620394 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.67■■■■□ 3.3
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SRRT-218ENST00000620394 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.63■■■■□ 3.29
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SRRT-218ENST00000620394 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.62■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 PLXNC1O60486 1568 aa35.61■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 CEP162Q5TB80 1403 aa35.6■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.57■■■■□ 3.29
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.57■■■■□ 3.28
SRRT-218ENST00000620394 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
SRRT-218ENST00000620394 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.54■■■■□ 3.28
SRRT-218ENST00000620394 ZMYM3Q14202 1370 aa35.53■■■■□ 3.28
SRRT-218ENST00000620394 ILDR2Q71H61 639 aa35.5■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.5■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 A2MP01023 1474 aa35.49■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.49■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 PLA2R1Q13018 1463 aa35.48■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.47■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
SRRT-218ENST00000620394 SOCS7O14512 581 aa35.44■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 TIAM1Q13009 1591 aa35.43■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.43■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 PTPRKQ15262 1439 aa35.41■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SRRT-218ENST00000620394 PKD2Q13563 968 aa35.35■■■■□ 3.25
SRRT-218ENST00000620394 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.34■■■■□ 3.25
SRRT-218ENST00000620394 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
SRRT-218ENST00000620394 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.31■■■■□ 3.24
SRRT-218ENST00000620394 GGT6Q6P531 493 aa35.29■■■■□ 3.24
SRRT-218ENST00000620394 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.27■■■■□ 3.24
SRRT-218ENST00000620394 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.25■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 MBD5Q9P267 1494 aa35.25■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.24■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.24■■■■□ 3.23
SRRT-218ENST00000620394 NCOA2Q15596 1464 aa35.22■■■■□ 3.23
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