RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
MLH1-223	ENST00000616768	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
MLH1-223	ENST00000616768	SNPH	O15079	494 aa		11.21	□□□□□ -0.61
MLH1-223	ENST00000616768	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R37	O75864	691 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	KIF3C	O14782	793 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
MLH1-223	ENST00000616768	ST18	O60284	1047 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MLH1-223	ENST00000616768	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MLH1-223	ENST00000616768	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.03	□□□□□ -0.64
MLH1-223	ENST00000616768	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	POTEM	A6NI47	508 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.99	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC34A2	O95436	690 aa		10.97	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	FOXK1	P85037	733 aa		10.96	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.95	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.95	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.93	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		10.93	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.92	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	SCRIB	Q14160	1630 aa		10.91	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	PDE4A	P27815	886 aa		10.9	□□□□□ -0.66
MLH1-223	ENST00000616768	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		10.88	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	DSG2	Q14126	1118 aa		10.87	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	EMP3	P54852	163 aa		10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	MFSD10	Q14728	455 aa		10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.86	□□□□□ -0.67
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	NES	P48681	1621 aa		10.82	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		10.81	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MLH1-223	ENST00000616768	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D12	O60347	775 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	ERBB3	P21860	1342 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCA2	P51531	1590 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		10.75	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69	5e-7	■■■□□ 17.6
MLH1-223	ENST00000616768	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT7	P0C024	238 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	CAMK2B	Q13554	666 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.72	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
MLH1-223	ENST00000616768	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MLH1-223	ENST00000616768	PBX2	P40425	430 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF11	O15085	1522 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.6	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	EVI5	O60447	810 aa		10.59	□□□□□ -0.71
MLH1-223	ENST00000616768	E2F4	Q16254	413 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.58	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	NCAPD3	P42695	1498 aa		10.57	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.57	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	FOSB	P53539	338 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.55	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	PTGER2	P43116	358 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.53	□□□□□ -0.72
MLH1-223	ENST00000616768	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	DPYSL4	O14531	572 aa		10.51	□□□□□ -0.73
MLH1-223	ENST00000616768	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.51	□□□□□ -0.73

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