RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

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Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.62■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 PREX2Q70Z35 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 AKNAQ7Z591 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 MIA2Q96PC5 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 NEO1Q92859 1461 aa22.56■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.54■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGRL1O94910 1474 aa22.54■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.53■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.51■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.5■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 RAPGEF3O95398 923 aa22.5■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ITGAEP38570 1179 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 AFAP1Q8N556 730 aa22.48■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.47■■□□□ 1.19
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NPIPB11-202ENST00000614927 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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NPIPB11-202ENST00000614927 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC1P33527 1531 aa22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.42■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 MBD5Q9P267 1494 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY4P0CV99 314 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY10P0CW01 314 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM6BO15054 1643 aa22.39■■□□□ 1.17
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NPIPB11-202ENST00000614927 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC5O15440 1437 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 DAPK1P53355 1430 aa22.36■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.33■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.31■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPRKQ15262 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RICTORQ6R327 1708 aa22.29■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM5CP41229 1560 aa22.27■■□□□ 1.16
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NPIPB11-202ENST00000614927 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP7AQ04656 1500 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.21■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.2■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF15Q9NS87 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 NCOA1Q15788 1441 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ROCK1Q13464 1354 aa22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP10AO60312 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGRL2O95490 1459 aa22.15■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 A2MP01023 1474 aa22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.11■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 PLXNC1O60486 1568 aa22.1■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF3BO15066 747 aa22.09■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.08■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 HFM1A2PYH4 1435 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 NAIPQ13075 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 MLECQ14165 292 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 GGT6Q6P531 493 aa22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 ERBINQ96RT1 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM52Q96A61 297 aa21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 REREQ9P2R6 1566 aa21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 AGLP35573 1532 aa21.96■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11-202ENST00000614927 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.95■■□□□ 1.1
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